1858年8月16日，石達開遣兵圍攻鬆溪、政和；二日後，撤圍西攻崇安、水吉、建陽，半月之內，一一克服。
福建巡撫慶端急谘周天受：水吉一鎮，地麵寬闊，為閩省水路要衝；此一失，賊逆勢必蔓延閩北，提台軍若入閩，煩請不辭勞苦，迅即提兵，殄滅此逆。
閩北告急，鹹豐帝亦諭令曾國藩速移援浙之師，由鉛山直搗崇安。
周天受接谘，即偕其弟、鶴麗鎮總兵周天培、遊擊戴慶吳、蒲城知縣張銓慶，兵分四路，圍攻蒲城。兩軍交戰半日，太平軍突開西門，退城而去。
周天受大喜，即刻督兵追剿，半月時間，閩北失地，邵武以外，全皆收複。
石達開屢戰屢敗，其下離心。
8月30日，檢點胡其相率兵六千，不辭而彆。9月12日，經略楊在田領兵一萬，出閩入贛，直奔景德鎮而去。未幾，花旗軍統領林彩新，率部萬餘，進入江西新城縣境。達開堂兄石鎮吉亦不聽調，擅自成軍，挺進閩西南。
張遂謀道：此勢不可再延，翼殿須速定去處。
石達開道：就依兄意，北入贛南，西取湘楚，就近入川。
1858年9月14日，曾國藩偕張運蘭、朱品隆、吳國佐各軍進抵建昌河口，就近砍殺胡其相一軍。
張運蘭急切入閩，曾國藩不許，道：經略撫州，建昌、景德，與吉安、臨江連作一片，且待賊來。
是日，曾國藩奏曰：據九江道沈葆楨、候選道李元度奏稱，訊據賊供，偽國宗楊輔清與石逆共帶賊黨十餘萬，楊逆先踞蒲城，石逆自衢、處敗竄入閩，窺犯廷建等郡。本年五月內楊逆仍假楊秀清偽號自稱東殿，石逆妒之，互相仇殺，楊逆遂帶賊六七萬棄蒲城而去，犯擾廣豐、玉山，分道而馳。石逆尚有七八萬眾，盤踞閩省各屬，狼奔豕突，未能測其所向。
10月中旬，石達開率軍攻入贛南瑞金，休整三日，分兵四擊。
江西巡撫耆齡以贛南方棘，無兵可撥，谘會曾國藩撥兵救援。
曾國藩不允，奏曰：南贛之賊，人數尚多，悍者較少，非一支客軍所能猝辦，必須本省兵力，輔以團練，方可徐起有功。
鹹豐帝諭令：石逆實乃悍賊，非地方之團練可以殄滅。著該侍郎統籌皖省全局，不必即日北行，俟南路稍鬆，再赴皖楚交界，籌辦大局。
國藩無奈，隻得暫駐建昌。
鹹豐帝再諭：石逆虐浙，浙人劾晏端書辦理不善、抵抗不力；著兩江總督何桂清查辦，胡興仁暫行署理浙江巡撫。賊勢日窘，已非鐵板一塊。前有僧格林沁，招降詹啟綸部，詹臣率毛勇南下，屢有斬獲。官文、胡林翼，勝保、和春、曾國藩等，亦應察言觀色，招納反士；為戰之道，亦非殺伐果斷，血流成河；不戰而屈人之兵，生靈無屠，善莫大焉。
胡興仁署撫，左宗棠不爽，谘責曾國藩道：兄台乃剿浙一等大員，可督四萬大軍；兩月方至，此行快乎？浙撫罔替，南柯一夢！胡興仁資曆平平，多事少為，駱撫曾劾；其人署浙，蘇杭成空！
曾國藩亦自責：吾之秉性，何其慢也！